在正常情况下，城市正规供水系统的自来水是不含阿米巴原虫的。我国对自来水的处理有着严格的标准，包括沉淀、过滤、消毒等多个环节，能有效杀灭或去除包括阿米巴原虫在内的各种微生物和病原体。但在一些偏远地区或供水设施老化、管理不规范的地方。

所谓的“食脑虫”，其实是福氏耐格里阿米巴原虫，它是一种生活在温暖淡水中的单细胞生物，极少情况下可通过鼻腔进入人体，引发一种罕见但致命的脑部感染——原发性阿米巴脑膜脑炎。不过，需要强调的是，这种原虫几乎不会出现在正规处理后的自来水中。