肠虫清作为一种有效的驱虫药物，对于人体的危害不会太大，但是使用肠虫清后会出现口干、乏力、嗜睡、头晕、头痛、恶心，上腹不适、谷丙转氨酶升高等不良反应，多可自行缓解。还会出现头痛、发热、皮疹、肌肉酸痛、视力障碍、癫痫发作等。