阿米巴原虫中最常见且最具致病性的是溶组织内阿米巴（Entamoeba histolytica），它主要寄生于人类肠道，引起的疾病叫做阿米巴痢疾，也称为肠阿米巴病。这种疾病是一种由寄生虫感染导致的肠道传染病，症状轻重不一。